Au 1er septembre 2026, votre officine doit pouvoir recevoir ses factures au format électronique via une plateforme agréée. C'est l'échéance qui vous touche en premier, parce que vos grossistes-répartiteurs sont de grandes entreprises : ils passent à l'émission obligatoire le même jour. Quatre d'entre eux réalisent près de 98 % des ventes de la répartition en France. Vous, vous n'émettrez qu'au 1er septembre 2027.
Le premier effet de la réforme sur une pharmacie ne viendra ni du comptoir, ni de l'Assurance Maladie, mais de vos fournisseurs.
Ce qui ne change pas : vos flux SESAM-Vitale
Commençons par la bonne nouvelle, parce que la question revient dans toutes les officines. Les feuilles de soins électroniques et les retours Noémie restent dans leur circuit habituel. Le tiers payant vers l'Assurance Maladie et les complémentaires relève d'un dispositif distinct, avec ses propres normes : vous n'avez rien à refaire de ce côté, et aucune plateforme agréée n'intervient dans cette chaîne.
Ce qui change concerne l'autre moitié de votre activité : ce que vous achetez, et ce que vous facturez à des professionnels.
Les quatre flux d'une officine, et ce qui arrive à chacun
Une officine cumule dans la même journée des opérations qui relèvent de régimes différents. D'où la confusion générale sur le sujet.
| Le flux | Ce que c'est | Ce qui s'y applique |
|---|---|---|
| Achats fournisseurs | Répartiteurs, laboratoires, génériqueurs, prestataires | Facture électronique reçue, dès le 1er septembre 2026 |
| Ventes au comptoir | Vos clients particuliers | E-reporting, aux dates de votre obligation d'émission |
| Ventes à des professionnels | EHPAD, maisons de santé, vétérinaires, entreprises | Facture électronique émise, au 1er septembre 2027 |
| Tiers payant | SESAM-Vitale, Noémie, complémentaires | Inchangé, hors périmètre de la réforme |
La première ligne vous concerne dans six jours. Les trois autres attendent 2027, ou ne bougent pas.
Pour vérifier votre situation exacte selon votre structure, vous pouvez tester votre éligibilité en quelques clics.
Pourquoi vos répartiteurs partent avant vous
La répartition française repose sur sept grossistes principaux, présents à travers 183 établissements, capables de livrer plus de 30 000 références en un peu plus de deux heures en moyenne. Ce sont de grands groupes, souvent adossés à des ensembles internationaux : ils émettent en électronique dès le 1er septembre 2026. Votre officine, presque toujours exploitée en SELARL ou en SELAS, relève de la catégorie PME et n'émet qu'en 2027.
Pendant un an, vous recevrez donc sans émettre. Et si votre officine n'est pas joignable sur le réseau au 1er septembre, ces factures partiront sans destination : vous perdez la charge en comptabilité et la TVA déductible associée tant que ce n'est pas régularisé.
Le point de vigilance propre à l'officine : le multi-taux
C'est la vraie difficulté technique de votre métier. Une seule facture de répartiteur peut mélanger quatre taux : 2,1 % sur les médicaments remboursables, 10 % sur les non remboursables, 5,5 % sur les laits infantiles et les appareillages pour personnes handicapées, 20 % sur la parapharmacie, la cosmétologie et le vétérinaire.
En papier ou en PDF, cette ventilation se ressaisit à la main. Une facture électronique porte au contraire un fichier structuré : les montants par taux sont lisibles par votre logiciel sans ressaisie. La réforme vous fait donc gagner là où votre comptabilité est la plus pénible. Le détail des règles est traité dans notre article sur la TVA en facture électronique.
Votre LGO ne fait pas tout
Votre logiciel de gestion d'officine gère la délivrance, le stock et la facturation SESAM-Vitale. Sur la réforme, tout dépend de votre éditeur : c'est à lui de raccorder le LGO au réseau des plateformes agréées, ou de vous dire qu'il ne le fera pas. Posez-lui la question par écrit maintenant, pas fin août. S'il ne couvre pas la réception des factures fournisseurs, ce flux se traite séparément : il ne dépend pas de votre outil de délivrance.
Le test qui prend une minute
L'annuaire de la facturation électronique est consultable gratuitement, sans compte ni mot de passe, depuis le portail Chorus Pro, par SIREN, SIRET ou dénomination sociale. Cherchez celui de votre officine : une adresse de facturation active signifie que vos répartiteurs savent où livrer. Aucune adresse signifie qu'il vous reste six jours pour agir. Le fonctionnement complet est détaillé dans notre article sur l'annuaire central.
Vos étapes, dans l'ordre
- 1
Cherchez le SIREN de l'officine dans l'annuaire
Gratuit, sans compte, depuis le portail Chorus Pro. Une adresse active signifie que vos répartiteurs peuvent vous livrer leurs factures.
- 2
Écrivez à l'éditeur de votre LGO
Demandez par écrit s'il raccorde votre logiciel à une plateforme agréée, et à quelle date. Une réponse floue est une réponse.
- 3
Raccordez-vous à une plateforme agréée
Directement, ou via une solution qui y est rattachée. Le raccordement demande quelques jours et les demandes s'accumulent fin août.
- 4
Listez vos clients professionnels
EHPAD, maisons de santé, vétérinaires, entreprises clientes. Ce sont ces factures qui passeront au format électronique en 2027, pas vos ventes au comptoir.
Comment choisir votre solution
148 plateformes agréées sont immatriculées par la DGFiP au 19 août 2026, après réussite des tests d'interopérabilité en conditions réelles, et 18 opérateurs de plus attendent leur immatriculation définitive. Vous n'avez pas à devenir vous-même une plateforme agréée : vous utilisez soit l'une d'elles directement, soit une Solution Compatible (SC) qui y est raccordée.
CashFacture est une Solution Compatible rattachée à une plateforme agréée partenaire immatriculée par la DGFiP. Nous ne sommes pas nous-mêmes la plateforme agréée, et nous ne remplaçons pas votre LGO : nous prenons la partie facturation et réception, connectée au bon canal. Le plan START est à 9 euros par mois, avec un essai de 7 jours (une carte bancaire est demandée à l'inscription). Voir nos tarifs pour comparer les formules.
L'assistance nationale dédiée à la réforme répond au 0 806 807 807, du lundi au vendredi de 8h30 à 18h.
Cas concret
Nadia, pharmacienne titulaire en SELARL, six personnes à l'officine
La situation
Elle pensait la réforme réglée par son LGO et par ses télétransmissions. Son éditeur lui a confirmé qu'il raccordait la partie délivrance, mais pas la réception des factures de ses deux répartiteurs, qui basculent à l'émission électronique dès le 1er septembre 2026.
Le résultat avec CashFacture
Elle a cherché son SIREN dans l'annuaire, constaté qu'aucune adresse de réception n'était active, et raccordé le flux d'achats via CashFacture, conforme via notre plateforme agréée partenaire. Ses factures de répartition arrivent ventilées par taux, sans ressaisie du 2,1 et du 20.
Questions fréquentes
La réforme change-t-elle mes télétransmissions SESAM-Vitale ?
Non. Les feuilles de soins électroniques et les retours Noémie restent dans leur circuit habituel, avec leurs propres normes. La réforme de la facturation électronique porte sur vos factures d'achat et sur vos factures à des professionnels, pas sur le tiers payant.
Mes ventes au comptoir deviennent-elles des factures électroniques ?
Non. Une vente à un particulier ne circule pas par le réseau des plateformes agréées. Elle relève de l'e-reporting, c'est à dire de la transmission des données de vente à l'administration, selon le calendrier de votre obligation d'émission.
Quand mon officine devra-t-elle émettre ses factures en électronique ?
Au 1er septembre 2027, comme les autres PME. Une officine exploitée en SELARL ou en SELAS relève de cette catégorie. En revanche, l'obligation de RECEVOIR s'applique dès le 1er septembre 2026.
Que se passe-t-il si mon officine ne peut pas recevoir de facture électronique au 1er septembre 2026 ?
Les factures de vos répartiteurs et laboratoires partent sur le réseau officiel sans destination. Vous perdez la charge en comptabilité et la TVA déductible associée tant que la situation n'est pas régularisée.
Mon logiciel de gestion d'officine suffit-il ?
Cela dépend de votre éditeur. Le LGO gère la délivrance, le stock et la facturation SESAM-Vitale. Le raccordement au réseau des plateformes agréées et la réception des factures fournisseurs sont des fonctions distinctes : demandez-lui par écrit ce qu'il couvre et à quelle date.
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